А как это сделать по Email ? Это можно, безусловно, только если читатель его укажет. Можно "обязать" комментатора оставлять свой Email (то есть, не позволять анонимные комментарии), если это не противоречит Вашим принципам.

1. Включить возможность получать все остальные комментарии к посту после того, как читатель оставил свой комментарий. В этом случае Вы просто даете ответ комментарием.
2. Если читатель подписался по Email (например, в Feedburner) ,  Вы можете ответить ему по электронной почте, так как имеете его адрес. Кстати - всячески рекламируйте подписку именно по Email, а не только на RSS-фид - это позволяет постепенно построить собственный "список клиентов".